FDH mbledh të dhëna mbi krimet e luftës dhe shkeljet e të drejtave të njeriut të kryera në kontekstin e luftërave jugosllave. Sot, arkiva e FDH përfaqëson koleksionin më të madh të dokumenteve, regjistrimeve audio-video dhe fotografive mbi këtë temë në rajon, me rreth 185.000 dokumente dhe materiale multimediale.
Një pjesë e veçantë e arkivës përbëhet nga koleksioni i plotë i regjistrimeve të gjykimeve të zhvilluara në Tribunalin Penal Ndërkombëtar për ish-Jugosllavinë (ICTY)/Mekanizmin Ndërkombëtar Rezidual për Gjykatat Penale (IRMCT), si dhe koleksioni i provave të paraqitura në këto procese gjyqësore.
Arkiva gjithashtu ruan dokumentacionin nga gjykimet për krime lufte në Serbi dhe rajon, dokumentacionin mbi shkeljet e të drejtave të njeriut në Serbi gjatë viteve 1990, dokumentacionin mediatik dhe atë që lidhet me kërkesat për rikthimin e të drejtave të banimit nga refugjatët dhe personat e zhvendosur.
Një pjesë e rëndësishme e arkivës përbëhet nga deklaratat e viktimave dhe dëshmitarëve të krimeve të luftës, si dhe regjistri i humbjeve njerëzore, të cilin FDH e zhvillon në bashkëpunim me partnerë nga shtetet e tjera post-jugosllave.
